Tên gọi khác: Kheyston Yonten Gyatso hoặc Jetsun Yonten Gyatso Jonangpa (1260-1326)
Yonten Gyatso (yon tan rgya mtsho) sinh năm 1260 trong một gia đình thực hành truyền thống Nyingma ở vùng Dok (mdog) của Tsang. Lần đầu tiên ông học tại Tu viện Dar (mdar dgon), nơi ông trở thành một chuyên gia về Vi Diệu Pháp và duy thức luận.
Ngài đã viếng thăm nhiều nơi khác và nhận giáo lý từ nhiều đạo sư mật tông. Tại Tu viện Sakya (sa skya dgon), ngài trở thành đệ tử và là thầy phụ tá chính cho đạo sư Sakya Sharpa Jamyang Chenpo Rinchen Gyeltsen (shar pa ‘jam dbyangs chen po rin chen rgyal mtshan, du.), người từng phục vụ với tư cách là Sakya Tridzin thứ mười ( sa skya khri ‘dzin) trong mười tám năm bắt đầu từ năm 1287. Từ Jamyang Chenpo, ngài nhận được nhiều giáo lý như Bộ ba Mật điển của Hevajra và những giáo huấn khẩu truyền liên quan, và các luận thuyết Đại thừa của Pramāṇavārttika (Trung Quán Luận), Abhisamayālaṃkāra (Hiện Quán Trang Nghiêm Luận, Abhisamayalamkara), và Nhập Bồ đề hạnh luận (Bodhisattvacaryāvatāra).
Từ anh trai của Jamyang Chenpo, bậc thầy Kalachakra Dukorwa Yeshe Rinchen (dus ‘khor ba ye shes rin chen, 1248-1294), Yonten Gyatso nhận những giáo lý như Mật điển Kalachakra, Mật điển Hevajra và Abhisamayālaṃkāra. Ngài cũng được yêu cầu trở thành người hầu cận của Yeshe Rinchen tại triều đình Hốt Tất Liệt ở Trung Quốc.
Yonten Gyatso trở về Sakya từ Trung Quốc bốn năm sau đó và tiếp tục việc học với Sharpa Jamyang Chenpo, nhận nhiều trao truyền như Mật điển Kalachakra và bình luận của nó, Vimalaprabhā. Jamyang Chenpo nhấn mạnh rằng Yonten Gyatso đã trở nên rất uyên bác và bây giờ nên tập trung vào thiền định. Vì mục đích này, ngài thúc giục ngài du hành đến Tu viện Jonang (jo nang dgon) và nhận những giáo lý như vậy từ bậc Tổ Jonangpa là Đức Kunpang Tukje Tsondru vĩ đại (kun spangs thugs rje brtson grus, 1243-1313).
Vào năm 1290, khi ngài ba mươi tuổi, Đức Yonten Gyatso đến Jonang và nhận được một số lượng trao truyền khổng lồ từ Kunpang, bao gồm lễ quán đảnh Kalachakra và trao truyền Tam tạng Bồ tát và các chỉ dẫn khẩu truyền liên quan. Đặc biệt, ngài đã thọ nhận nhiều truyền thống khác nhau về những chỉ dẫn khẩu truyền về 6 pháp yoga Kim cương của Kalachakra.
Người ta kể rằng khi ngài thực hành thiền định trong ẩn thất tối tăm, tất cả mười dấu hiệu của tịnh quang đã xuất hiện trong 21 ngày. Khi Ông thực hành thiền định ban ngày, những trải nghiệm thể chất rất mãnh liệt xảy ra trong bảy ngày. Khi những trải nghiệm này trôi qua, Yonten Gyatso vẫn ở trong trạng thái bình thản tuyệt vời và sở hữu khả năng thấu thị không bị cản trở. Ông ở lại Jonang trong ba mươi tám năm tiếp theo, tập trung chủ yếu vào việc thực hành yoga sáu nhánh. Nói chung, ngài được cho là đã tiếp nhận và thông thạo tất cả giáo lý có sẵn ở Tây Tạng và đặc biệt nổi tiếng về tính chính trực về mặt đạo đức.
Sau khi Kunpang qua đời và đệ tử của ông là Jangsem Gyelwa Yeshe (byang sems rgyal ba ye shes, 1247-1320) lên ngôi tu viện, Yonten Gyatso nương tựa Gyelwa Yeshe như ông đã nương tựa Kunpang. Đầu tiên, ông là người bạn, sau đó là đệ tử, và cuối cùng là người kế vị Gyelwa Yeshe trên trụ trì tu viện Jonang, đảm nhận chức vụ trụ trì vào khoảng năm 1319.
Ông đã đạt được lợi ích to lớn cho dòng truyền thừa thực hành và giữ trụ trì tu viện trong khoảng bảy năm. Năm 1326, ông chỉ định đệ tử của mình là Dolpopa Sherab Gyeltsen (dol po pa shes rab rgyal mtshan, 1292-1361) làm người kế vị và sau này trở thành vị Tổ thứ 4 sáng chói của Jonangpa.
Xem thêm lịch sử Tổ thứ 2 Jangsem Gyelwa Yeshe
Xem thêm Lịch sử Vị tổ thứ 4 dòng truyền thừa Jonangpa: Đức Phật Dolpopa
Sau gần 800 năm Ngài đã tái sinh trở lại và hiện là bậc Tulku H.E. Dechen Dorjee Rinpoche
